Interatomique
Le plateau d'interactomique du CBSA comprend un appareil SPR (Surface Plasmon Resonnance), des outils de docking moléculaire de bases, et un appareil MST (MicroScaleThermophoresis). Ce plateau est intégré à la Plateforme de Sécurité Sanitaire d'Evreux (PS2E).
La technique de SPR permet de visualiser des interactions entre une cible fixée sur un support et un ligand en phase liquide qui est injecté dans l'appareil SPRi qui permet de visualiser en direct la liaison.
La technique de MST permet de mesurer des constantes d'affinité entre une cible marquée (par un dye rouge ou par la GFP) en concentration constante dans 16 capillaires et un ligand potentiel à 16 concentrations différentes après une cascade de dilution au demi. Cette technique nécessite très peu de matériel biologique. Après vérification et validation de la quantité de fluorescence contenue dans les 16 capillaires, les 16 courbes de thermophorèse sont réalisées en 14 minutes. Cette technique qui nécessite peu de produit biologique a permis au laboratoire CBSA de valider plusieurs Kd pour des interactions entre peptides et protéines et entre protéine et ARN.
Références de publication du laboratoire CBSA sur cette thématique :
- Rosay et al., 2015 MBio 6(4):e01033-15
- Louis et al., 2022, Adv. Sci. 9(7):e2103262. doi: 10.1002/advs.202103262
- Soussan et al., 2023 Front. Microbiol. 13:1070116
- Salze et al., 2020, RNA Biol Jun; 17(6):794-804
- Karami et al., 2023, J. Chem. Inf. Model. doi: 10.1021/acs.jcim.3c00865.
Contacts: Florian Defontaine: florian.defontaine1@univ-rouen.fr ou Olvier Lesouhaitier: olivier.lesouhaitier@univ-rouen.fr